2020年我院共发表论文110篇，其中SCI收录74篇，包括一区16篇，二区27篇，最高影响因子8.154，出版专著1部。
2021年我院共发表论文共计115篇，其中SCI 80篇，一区11篇，二区34篇，三区，19篇，四区16篇，核心35篇。
2022年我院共发表论文134篇，其中SCI92篇，一区13篇（一区Top7篇，最高影响因子达到10.735）、二区54篇（二区Top9篇）、三区18篇、四区7篇，中文核心期刊42篇。我院王傲雪教授著作的《番茄生物技术》成功入选国家自然科学与工程技术出版规划农业科学项目。
2023年共计发表学术论文130余篇，其中SCI论文84篇，一区23篇（一区Top17篇，）、二区45篇（二区Top8篇）、三区8篇、四区8篇，EI收录2篇，中文核心期刊44篇；其中吴凤芝、周新刚团队在《Molecular plant》和《Plant physiology》等经典期刊发表论文。
2024年共发表论文140篇，其中SCI101篇，一区31篇（一区Top28篇，王傲雪教授等在一区Top期刊《园艺研究Hortic Res》、周新刚研究员等在一区Top期刊《Nature Communications》、杨欢欢副教授等在一区Top期刊《Horticulture Research》、吴凤芝教授在一区Top期刊《Microbiome》上发表研究论文，特别是风景园林学科胡海辉教授率领的“城市绿地与数字虚拟技术”团队首次突破性的在建筑环境领域期刊《Building and Environment》（中科院一区TOP，IF: 7.1）上发表研究论文）；二区56篇（二区Top26篇）、三区6篇、四区8篇，中文核心期刊39篇。
2025年共发表论文104篇，其中SCI收录93篇，包括一区25篇（一区Top22篇）、二区44篇（二区Top14篇）、三区17篇、四区7篇，中文核心期刊11篇。文章质量较往年有大幅提升，生理生态、西甜瓜、番茄、小浆果、景观与数字虚拟技术等团队先后在《Cell Host & Microbe》、《Plant Communications》、《Plant Physiology》、《Horticulture Research》、《Food chemistry》、《Theoretical and Applied Genetics》、《LWT-Food Science and Technology》、《Sustainable Cities and Society》等一区TOP期刊发表论文，期刊数量、发表论文团队人数相比往年进一步增多，呈现多点开花的局面。
